在使用方式上
Windows用户更倾向于使用图形界面（GUI）进行相关的操作，他们利用鼠标和界面跟可视化的用户图形界面进行交互。而Linux用户更多的是通过键盘和字符界面，借助丰富而强大的命令行就能对系统操纵自如，这里明显可以看出使用Linux的学习成本是远远高于Windows的。
应用程序支持方面
Windows上拥有丰富的应用程序支持，而Linux也不乏力，但是对图形化应用工具而言，Linux上拥有的数量是远不及Windows的。但是反之，Linux的管理工具层出不穷，开发和生产支持的底层元件更丰富和稳定（如我们日常访问的网站后台，绝大多数都是奔跑在安装Linux的服务器租用上）。
简言之，Linux的应用，更多是为开发者和生产环境而准备的，而Windows则更倾向于满足其庞大的家庭用户。
系统个性化方面
开源的Linux系统更容易接受定制。Linux有很多发行版（如Debian、Redhat等），而每一个发行版团队都会对Linux进行维护和软件的更新，更衍生了多个Linux发行版派系。由于Windows是闭源的，并且仅由微软公司所支持和维护，因此在个性化方面稍微欠缺，但Windows每一个发行版都是进步，只能说是见仁见智。
对于应用场景
Linux更受开发者的青睐，由于Linux系统稳定、安全、强大，非常适合作为开发环境或实际生产环境。相反，Windows则聚焦在桌面操作系统上，适合大多数的主机租用用户，能提供丰富的软件服务和简单的操作方式。
事实上，Linux也一直在尝试为众多的家庭用户做出改变，光是桌面环境Linux就有Gnome、Unity等风格，而Windows的Server则一直在追赶着Linux脚步，目前而言，Windows Server也在日趋完善之中。
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