如果是网站的话，网站的程序代码用的是php或jsp开发，建议用LINUX系统比较稳定，速度快。如果是ASPX 和ASP mssql架构的话，建议用WIN2008 WIN2012。如果作为数据库服务器的话，而数据库是MYSQL 和ORACLE，建议用LINUX，是MSSQL的话，用WIN就可以。
Linux操作系统
Linux操作系统的价格更低廉，因为它是开放源码的，这意味着你可以安装操作系统中所有的选项。Linux操作系统能吸引大量的服务器管理员，因为它无需软件的许可证授权费用。
Linux可以支持PHP, MySQL和Perl编程语言。而另一方面Windows系统则不支持这些语言。如果打算或者正在网站上使用这些脚本或代码，使用Windows操作系统的话就无法正常工作。脚本在不同平台上不是都兼容的。
很多服务器技术人员在将他们的网站在Windows上进行转换会碰到一些Linux软件不会遭遇的问题。但是将网站转化为Windows平台是比较简单和灵活的。
Windows操作系统
由于Windows系统不是开源操作系统，因此价格比Linux系统要贵。根据你决定使用的操作系统类型不同，花费不等。微软开发的.NET技术是很有意义的，Windows操作系统可以为其提供支持。另一方面Linux系统则无法支持.NET技术。
基于专用服务器的Windows操作系统可以支持Microsoft Access或者Microsoft SQL。这些数据库在Linux专用服务器下是无法运行的。
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